由海峽兩岸中醫藥合作發展交流協會發起，在國務院臺辦和國家中醫藥管理局的支持和推動下，自2009年舉辦首屆“海峽兩岸中醫藥合作發展論壇”，至今已舉辦第三屆。“2011第三屆海峽兩岸中醫藥合作發展論壇＂是在前兩屆的基礎上又一次的兩岸中醫藥盛會。本屆論壇邀請了兩岸近六百名中醫藥專家、學者與會，大會論文集收錄的百余篇優秀論文。
今年論壇有四點特色：第一、中醫藥學者專家眾多，橫跨領域廣泛；第二、專家學術水平高、專題報告精采；第三、大會組織嚴謹，論壇過程有序；第四、場外展示生動、廠商互動活躍。綜合以上，可發現此次論壇學術和經貿交流融為一體，并依此形成論壇特色。
本次論壇在臺中市政府的大力支持下，提供場地和人員的服務，其中，臺中市衛生局黃美娜局長全程參與論壇。黃局長致歡迎詞時表示：此次論壇在臺中舉辦，使臺中市“健康城市”的市政發展目標更進一步，并期望論壇成果能對臺中市民未來的市民健康需求提供建言。大會也精心規劃論壇的流程和動線，會后安排參訪臺中醫院和臺中慈濟醫院，讓與會學者、專家能賓至如歸，全心全意的參與論壇，為論壇取得良好成效奠定基礎。
此次大陸主辦單位中華中醫藥學會，在國務院臺辦和國家中醫藥管理局的指導精神下，完善各省學者、專家的召集工作，并詳細的向各省作行前通知。在中華中醫藥學會的努力下，將來自三市九省（北京、天津、重慶、黑龍江、遼寧、青海、云南、山東、江蘇、福建、廣西、陜西）相關中醫藥專家學者作了完善組織，使論壇的舉辦和參訪能順利完成。大陸總團長，國家中醫藥管理局辦公室副主任趙明女士大會致詞中提出：期望未來論壇在《海峽兩岸醫藥衛生合作協議》的架構下，持續為中醫藥研究與交流及中藥相關產業交流等領域協助搭建平臺，并為今后雙方交流合作向更大規模、更高規格和更深領域發展做出新的努力。
臺灣中南部素來對大陸的發展較為陌生，由于此次論壇的舉辦，讓臺灣中醫藥專家和一般民眾對大陸中醫藥發展有了深刻的認識。論壇當天的晚宴上，臺灣中醫藥專家更自發的組織表演節目，將論壇推向的最高潮，兩岸中醫藥學者、專家歌唱在一起，心連成一片，情感也更加濃厚。
由于此次論壇的順利舉辦，臺灣中醫藥專家在論壇上也期望能將“海峽兩岸中醫藥合作發展論壇”繼續舉辦下去，為傳統中醫藥的發展、為兩岸中醫藥學者、專家的交流和為兩岸民眾的健康繼續奮斗。大陸學者專家們也期望論壇的持續舉辦，學術和經驗的不斷交流，將可為中華中醫藥未來的傳承和發展推向高峰。
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